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截至2014年5月，学校设有13个二级学院，设置21个本科专业。 学院专业基础医学院 中医学(七)中医学(七)(传统型中医)中医学(七)(中西医结合)中医学(七)(针灸推拿)中医学(七)(医药结合)中医学(七)(中医学)中医学(五)中医学(五)(中医学)中医学(五)(全科医学)中医学(五)(骨伤科学)中医学(五)(中医药文献信息工程)中医学(五)(医药法学)中医学(五)(中西医结合)中医学(学分互认)中医学(专升本)中西医临床医学本科康复治疗学本科中医康复保健药学院 中药学本科中药学本科(药学)中药学(学分互认)中药学(专升本)药学本科制药工程本科制药工程本科(生物制药)市场营销本科市场营销(学分互认)市场营销(专升本)市场营销(运动员)中草药栽培与鉴定本科中药学专科中药学互认后专科中药资源与开发市场营销专科市场营销互认后专科市场营销专科中药经营与管理 针灸推拿学院 针灸推拿本科针灸推拿本科(英语)针灸推拿本科(运动医学)针灸推拿(专升本)针灸推拿(学分互认)营养学(本科)针灸推拿(专科)针灸推拿互认后(专科) 护理学院 护理学本科护理学本科(英语)护理学(学分互认)护理学(专升本)护理学(专科)护理学互认后(专科)护理学(专科) 人文社科学院 应用心理学(本科)法学(本科)
公共事业管理(本科) 外国语学院英语信息管理学院 信息管理与信息系统(本科) 理工学院生物医学工程(本科)计算机科学与技术(本科)眼视光学(本科)体育艺术学院运动人体科学(本科)国际教育学院 继续教育学院 截至2014年5月，学校有3个博士后科研流动站，有3个博士学位授权一级学科、15个博士点；8个硕士学位授权一级学科、44个硕士点，硕士点涵盖了中医学、中西医结合、中药学全部二级学科，并开始向周边学科渗透；拥有临床医学博士专业学位授予权和临床医学、中药学、药学、生物医学工程硕士专业学位授予权。学校有2个国家重点学科和1个国家级重点（培育）学科，省级重点学科14个，国家中医药管理局重点学科29个。
博士后科研流动站（3个）：中医学、中药学、中西医结合。
博士学位授权一级学科（3个）：中医学、中药学、中西医结合。
硕士学位授权一级学科（8个）：中医学、中药学、中西医结合、生物医学工程、药学、心理学、临床医学、护理学。
国家重点学科（2个）：中医基础理论、中医医史文献。
国家重点（培育）学科（1个）：中医内科学。
省级重点学科（14个）：中医基础理论、中医医史文献、中西医结合基础、中药学、针灸推拿学、中医儿科学、方剂学、中医妇科学、中医内科学、中医外科学、生药学、眼科学、中医骨伤科学、中医全科医学。
国家中医药管理局重点学科（29个）：中医基础理论、中医文献学、中药药剂学、中西医结合基础、中西医结合临床、中医心病学、中医脑病学、中医肿瘤病学、中医妇科学、中医儿科学、中医全科医学、针灸学等。 截至2014年5月，学校有教职医护员工3300余人（含三所直属附属医院），其中，博士生导师76人，硕士生导师370人。1人先后荣获国家“国医楷模”、“国医大师”荣誉称号，有国家“973”项目首席科学家1人，全国杰出专业技术人员1人，全国优秀教师8人，省部级有突出贡献的中青年专家12人，山东省“泰山学者”特聘教授8人，享受国务院特殊津贴43人，山东省教学名师8人，山东省有突出贡献的名老中医药专家5人，山东省名中医药专家55人，山东省教学团队6个，省级优秀创新团队1个。
山东省高等学校省级教学团队团队名称带头人入选时间中医基础理论教研室教学团队孙广仁2007年中医诊断学教学团队刘家义2008年中医文献学教学团队王振国2009年针灸学课程教学团队谭奇纹2010年中医外科学教学团队宋爱莉2011年中医方药学教学团队王均宁2012年 山东省优秀创新团队团队名称带头人入选时间情志病症研究创新团队乔明琦2008年 质量工程
截至2014年5月，学校有4个国家级特色专业，1个教育部综合改革试点专业，11个省级特色专业；建设2门国家级精品资源共享课，33门省级精品课程。学校有1个国家级实验教学示范中心、1个国家级大学生校外实践教育基地。
国家级实验教学示范中心（1个）：山东中医药大学中医药综合教学实验中心。
国家级大学生校外实践教育基地（1个）：山东中医药大学附属医院临床技能综合培训中心。
国家级特色专业（4个）：中医学、中药学、针灸推拿学、制药工程。
教育部综合改革试点专业（1个）：中医学。
省级特色专业（11个）：中药学、制药工程、康复治疗学、护理学、应用心理学、信息管理与信息系统、眼视光学、中草药栽培与鉴定、中西医临床医学。
国家精品资源共享课（2门）：中医基础理论、中医文献学概论。
国家级精品课程（3门）：中医基础理论、中医文献学概论、中医外科学。
省级精品课程（33门）：中医基础理论、中医诊断学、中医文献学、中药鉴定学、中药商品学、针灸学、伤寒论、中药药剂学、中医古汉语基础、内经选读、金匮要略、中医儿科学、中医外科学、中医内科学、推拿学、方剂学、药用植物学、中药炮制学、针灸治疗学、中药学、中医护理学、急救护理学、临床护理综合技能、护理管理学、中医心理学、中药资源学、药用植物栽培学、生药学、中药化学、分析化学（仪器分析）、中医各家学说、温病学、中国医学史。
合作交流
截至2014年5月，学校先后与亚洲、欧洲、非洲、美洲、澳洲、港澳台等国家和地区的六十余所高等教育、医疗科研机构建立了长期的友好合作关系，合作办学、合作办医。国际教育学院负责招收和培养外国留学生、台港澳华侨学生，开展本科、硕士和博士三个层次的学历教育及各类短期培训项目，能够用英语、日语、韩语等多种语言授课。现有外国留学生、境外合作办学学生、港澳台学生400余人。每年招收各类短期学习和进修生100余人。 馆藏资源
截至2014年5月，学校图书馆馆藏纸质图书110万册、电子图书47万册。馆藏的中医药文献中，线装古籍2.9万册，包括木刻本、石印本、手抄本、影印本等，其中，乾隆以前出版的珍、善本图书172种，共1700余册，收藏最早的是明代正德十年（1515年）的《铜人针灸经》一书，收藏最为完整的是《金匮伤寒》。图书馆馆藏孤本书有十多种，包括明代天启六年李盛春汇集的《医学研悦》（共十册一函）、清代康熙年间的《按摩经》（手抄本）以及光绪二十二年叶天士的《秘本种子金丹》（石印本）等。
学术期刊
《山东中医药大学学报》是Caj-cd规范获奖期刊，被国内多家数据库长期收录（如中国知网、万方数据库、清华同方、维普资讯等），2004年被国家科技部评选为中国科技核心期刊、中国科技论文统计源期刊。 厚德怀仁 博学笃行
厚德，犹大德。语出《周易·坤》：“地势坤，君子以厚德载物。”《淮南子·氾论训》亦谓：“故人有厚德，无间其小节。”厚德载物的意思是说，以深厚的德育人利物。
怀仁，其意为心怀仁德。语出汉陆贾《新语·道基》：“圣人怀仁仗义。”
博学，意为广泛的学习。笃行，意为切实履行，专心实行。语出《礼记·中庸》：“博学之，慎思之，明辩之，笃行之。”《礼记·儒行》：“儒有博学而不穷，笃行而不倦。”其中“博学”、“审问”属于学的过程，“慎思、“明辩”是思的过程，“笃行”则是习和行的过程，“博学”意指广泛地学习人文知识及与医学有知的科学文化知识；“笃”意指忠实，专注，一心一意。“笃行”意指对医学事业专心致志，锲而不舍，知难而进，勇往直前，也包含有百折不挠，愈挫愈勇的精神。 1.校徽外圆半上部为蓝色，书写繁体的“山东中医药大学”；外圆下半部为绿色，书写学校的英文全称。
2.校徽中心的主体图案是一个红色的“中”字，代表“中医药”。
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